去愛妮島，依照在菲律賓出發地點有不同方式，最便捷的方式是從馬尼拉搭乘舒適的AirSWIFT航空，50人座ATR42-500型客機前往。
這裡有三件事情必須先說明，首先是在2015年原來承載馬尼拉與愛妮島之間的航空公司ITI航空，從專營島嶼間運輸的小型航空公司，轉型升格成為正式的國內定期航班公司，因此也重組並更名為AirSWIFT航空，以新形象服務旅客，所以去愛妮島，不要再找ITI，它已經不存在了。
第二件說明是AirSWIFT的前身ITI航空，在專營愛妮島航線之初，是用19人座最適短跑道起降的Dornier型飛機營運(台東飛蘭嶼同機型)，其在馬尼拉的候機室包括辦登機手續櫃檯，就設在機場邊緣的停機棚旁，時間到了，飛機從停機棚推出來，乘客上機，就起飛了。
再插播一件鮮有人知的事，即在愛妮島的機場是愛妮島度假村的控股公司Ten Knots在巴拉望本島所擁有的大片土地上建造的，當然也擁有機場的所有權。經過二十餘年營運，對愛妮島觀光資源深具信心，而在愛妮島機場旁的土地上，有興起造鎮的計劃。首先先把機場跑道擴建，在2012年第二條1000米長跑道完工落成之時，ITI航空也同時從19人座機型，更換為可載運50人的中型飛機，機上有洗手間，也有空服員招待茶點服務。
更換機型後，ITI航空仍沿用在馬尼拉停機棚的候機室，因為這專用場地已裝潢成海島的氣息，在旅客出發前已能體驗度假的樂趣，休息室備有咖啡、茶點、書籍，增添候機享受舒適。
第三件重大說明，是當ITI更名為AirSWIFT航空之後，於2016年增加每天一班班機，飛行於宿霧與愛妮島之間。此時AirSWIFT航空升格為國內定期航班航空公司之態，已儼然成形。於2016年3月15日，將報到登機櫃檯，正式遷移到馬尼拉國內線機場Domestic Airport，通稱第四航廈Terminal 4或T4。這個遷移，有利於在T4各個航空公司的旅客方便與AirSWIFT銜接轉運，是其營運上重大進展。
總而言之從馬尼拉前往愛妮島第一選擇是每日四班的AirSWIFT班機，時間表如下：
馬尼拉→愛妮島
06:30→07:30
09:55→11:10
11:00→12:15
14:00→15:15
愛妮島→馬尼拉
08:00→09:15
12:00→13:15
16:00→17:15
17:35→18:50
機票可以找萬大代訂，但住在愛妮島度假村五村中任一村的旅客，可享較優惠票價。因為度假村與航空公司，已有三十年的合作關係，但優惠票價不能單獨使用，必須以套裝方式，反映在旅行社的機加酒行程報價中。
第二種前往愛妮島方式，是飛到愛妮島所在的巴拉望省省會公主港，再搭車前往愛妮島的阿普莉度假村Apulit，車程約四小時，再轉快速渡船約30分鐘可達。
從公主港前往愛妮島渡假村集團其餘四個度假村，車程約五小時半。愛妮灣度假村EL Nido Cove Resort無需再轉船，其餘潘嘉露香Pangulasian、拉根Lagen及迷你諾Miniloc度假村，則分別轉專屬渡船約45分鐘可抵達。 這樣走法可省去AirSWIFT的國內線機票，只要買馬尼拉到公主港廉價航空機票，單程約2000元起跳。
這幾小時的車程，並不太困難，看看菲國鄉野風光，中途休息品嚐當地小吃也不錯。尤其搭乘紅眼航班，從台北到馬尼拉的旅客，正好在車上補眠，所以只要轉機班機銜接沒問題，很多人採用這種走法。
第三種走法是從宿霧飛到愛妮島，這是2015年12月宿霧太平洋航空開航台北宿霧每週四班直飛班機，才有的走法。2016年3月長榮航空，開闢每日一班台北宿霧直飛班機，提供了一石二鳥的機會。從宿霧到愛妮島用AirSWIFT做往返。
AirSWIFT航班資訊如下：
宿霧→愛妮島 15:15→16:55
愛妮島→宿霧 12:55→14:35
第四種前往愛妮島方式，是背包客勇於嘗試的方法，就是從新興熱門景點巴拉望省科隆鎮，在遊完了科隆的島中湖、珊瑚花園及日軍戰艦沉船遣骸，潛水或浮潛之後，搭乘傳統班卡船Banca乘風破浪，歷經八小時可抵愛妮島鎮碼頭。每天都有一班船，船票外國人票價為1800披索，含簡餐，售票處很多，例如www.lakas.com.ph。
前往愛妮島愈來愈方便快捷，選擇也多，唯處在颱風帶的菲律賓不論飛機或船班，或有不可測因素，事前能做規劃，或洽專業諮詢，乃為一趟菲律賓最迷人的海灣~愛妮島旅遊，不可或缺之措施。
資訊更新(2019.05.10)：
近年新增ATR-72-600型客機，載客72人，現在機隊已有5架ATR客機，飛航10個城市及旅遊景點。萬大旅行社(02)25210100 在台灣可代售即時確認機票，所有航線均可服務，已無之前僅服務住在愛妮島度假村旅客的限制。
2019年5月發布消息，愛妮島度假村控股集團的菲律賓最大地產投資公司之一阿亞拉Ayala，在旅遊項目，更擁有了AirSWIFT，並開發麗歐濱海城Lio Tourism Estate。不計入旗下全菲十餘家商務型飯店Seda，現在在愛妮島飯店，已共有350間客房，計畫到2025年，再增加數家飯店，使客房數達1500間。
在五架飛機運作下，各點之間航班已比2017年增加很多。
迄2019年5月，台灣有航空直飛的宿霧、薄荷島、長灘島、巴拉望公主港、克拉克，從這五個熱門旅遊點，都可搭AirSWIFT直飛愛妮島，從科隆島也有直飛愛妮島。雙島遊已蔚為菲律賓旅遊趨勢。
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